На этот вопрос вам, скорее всего, никто не ответит.
Для синхронизации товаров используется API функция /shops/goods, можете проверить что она возвращает, обратившись по адресу
http://api.powerpartners.ru/v2.0/shops/ ... en=xxxxxxx (подставьте свой токен). Для всех товаров возвращается "quantity": 20.
На дефолтной установке OpenCart + плагин по инструкции
https://github.com/powerpartners/opencart-mod - все работает как надо, остатки товаров по 20 шт после синхронизации.
Но, как показала практика, в OpenCart любой плагин, мод и даже скин может влиять на работу системы самым непредсказуемым образом.
Поэтому разобраться, что там в вашей инсталяции OpenCart поломалось и почему - может лишь программист вооруженный отладчиком.